أنشأت جامعة ظفار ونفذت "نظام إدارة السياسات" الرسمي (PMS) في نوفمبر 2010. ويُعنى نظام إدارة السياسات بتحديد المجالات التي تتطلب صياغة السياسات، واتخاذ الإجراءات والمبادئ التوجيهية ذات الصلة، والتنفيذ السليم للسياسة ومراجعتها بشكلٍ دوريّ.

وعلى مدار فترةٍ من الزمن، قامت الجامعة بتطوير وتنفيذ عدد من السياسات التي تغطي مختلف جوانب عملياتها الأكاديمية والإدارية، وذلك وفقا لمتطلبات وزارة التعليم العالي والبحث العلمي والابتكار و/أو هيئة الاعتماد الأكاديمي العمانية. وحتى الآن، طوّرت الجامعة مجموعة شاملة من 36 سياسة، تنقسم إلى أربع فئات رئيسية - (1) السياسات الأكاديمية، (2) السياسات الإدارية، (3) سياسات البحث العلمي والاستشارات، (4) سياسات الموارد البشرية.